La impresionante iglesia de color rosa que hoy vemos, construida en el siglo XVI (y reformada en diversas ocasiones), es célebre porque acoge los restos mortales de tres famosos santos peruanos: San Juan Macías, Santa Rosa de Lima y San Martín de Porres (primer canonizado negro del continente). Las tumbas están en el convento pero las reliquias se conservan en un santuario a la derecha del altar.